Veterinaar- ja Toiduameti põhimäärus on kinnitatud põllumajandusministri 13. juuni 2007. a määrusega nr 91, Veterinaar- ja Toiduameti ning tema kohalike asutuste struktuur ja teenistujate koosseis põllumajandusministri 19. veebruari 2013. a käskkirjaga nr 53.

Veterinaar- ja Toiduameti (VTA)  kohalikud asutused tegutsevad põllumajandusministri määrusega kinnitatud põhimääruste alusel:

• Harjumaa Veterinaarkeskus
• Hiiumaa Veterinaarkeskus
• Ida-Virumaa Veterinaarkeskus
• Jõgevamaa Veterinaarkeskus
• Järvamaa Veterinaarkeskus
• Lääne-Virumaa Veterinaarkeskus
• Läänemaa Veterinaarkeskus
• Põlvamaa Veterinaarkeskus
• Pärnumaa Veterinaarkeskus
• Raplamaa Veterinaarkeskus
• Saaremaa Veterinaarkeskus
• Tartumaa Veterinaarkeskus
• Valgamaa Veterinaarkeskus
• Viljandimaa Veterinaarkeskus
• Võrumaa Veterinaarkeskus